Apres avoir cherché pendant un moment, j'ai réussi à faire la connexion entre Pianoteq et Muscore, tuto video vite fait, il vous faut le serveur audio Jack et le freeware de port midi virtuel LoopBe.
http://onirike.free.fr/ressources/connexion_Muscore_vsti.mp4
J'ai oublié de préciser les réglages du serveur jack pour le path:
server path :jackd -S -R -X winmme
Driver : portaudio